陈寅恪治史，其方法亦大致同此，而其有别于王国维者，是他更注重于史事、制度的渊源流变，如《隋唐制度渊源略论稿》一书，即是“综合旧籍所载之有关隋唐两朝制度者，分析其因子，推论其源流，成此一书”，以补“吾国史学之缺憾”。它同《唐代政治史述论稿》是姊妹篇，皆为名作。陈寅恪撰成《元白诗笺证稿》一书，是以诗文证史的开创性杰作，在历史视野和治史方法上，都有重要价值。
陈垣也是新历史考证学派的杰出史家。他以广泛的研究领域、严谨的考证方法和缜密的类例原则，把传统的历史文献学推进到新的阶段，在校勘学、目录学、年代学、避讳学、史源学、辑佚学等方面都有建树；他在中西交通史和宗教史研究方面，也是杰出的开拓者。《励耘书屋丛刻》收录了他的几部名作（其中《史讳举例》一书对纠正因不懂避讳而造成的常识性错误非常重要）。而未收录之名著还有多种，如他的《二十史朔闰表》和《中西回史日历》两部年代学方面的著作，是中外学人不可不用的著名的工具书。他的《明季滇黔佛教考》等宗教研究和宗教史著作九种亦独具风采。